四川省医学会起源最早可追溯到民国时期。1927年5月，学会前身“四川医学会”在成都成立，为当时四川最早也最有影响力的医学学术团体。自1979年6月学会恢复活动以来，接受党和政府的领导，坚持学会宗旨，完善制度，加强管理，建设组织，依靠专家，创新发展，历经七届理事会，在一代代学会工作者的努力下，学会事业不断发展、壮大。尤其近年来，学会在以沈骥会长为首的第七届理事会的领导下，开拓创新，学会各项工作取得明显成绩。目前已成为我省组织机构最为健全、会员队伍与业务活动规模最大的科技类社团，同时也是我省最具代表性和权威性的医学专业学术组织，在西部省（市）区医学会中处于领先地位，具有一定国际影响力。
截止2017年7月，学会设置分支机构包括专业委员会81个、学组97个、青年委员会55个，吸纳了全省优秀医学专家8770余人(次)；单位会员469家，包括川大华西医院、华西二院、省人民医院、成都军区总医院等我省顶尖医院，同时涵盖了几乎全省所有三级医疗机构；专科高级会员7217人，个人会员80635人，同时指导各市、州医学会21个。
学会以开展学术交流活动为主要任务，此外还开展继续医学教育、科技扶贫、科普宣传、健康教育活动；开展医药卫生科学技术咨询与服务工作，举办医药卫生科学技术展览；评选和奖励优秀的医学科技成果；发现、推荐和培养优秀科技人才，宣传、奖励优秀医务工作者等；承接政府各项职能，包括科技评审、医疗机构评审、医疗技术审核，开展医疗事故技术鉴定和预防接种异常反应鉴定等医学鉴定工作，开展专业技术人员技术培训、考核等工作；另外，学会还主办了《四川医学》、《实用妇产科杂志》两种学术性期刊。
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